短时的间断灌肠治疗对全身的影响不大，不良反应少，是一种较好的通便方法，可用于急性便秘（如急性粪嵌塞）。有时也可采用这种方法刺激直肠，以达到重新建立直肠排便反射的作用，可用于一些便秘病人的早期治疗。灌肠疗法也是小儿便秘的基本治疗方法，常用于小儿特发性便秘或先天性巨结肠通便。
第三：给孩子用不该用的激素，随意改变药物的使用方式，可能导致过敏、耐药风险，局部药物刺激也可能引发结肠炎，灌肠还可能改变肠道正常菌群环境，诱发肠道感染，长时间保留大量液体灌肠还可能导致孩子水电解质紊乱，甚至死亡。
实际上，相较于灌肠而言，口服给药无需额外费用，且通常其吸收速度和程度都要高于直肠给药。注射给药则更为快捷，药物不会被胃肠道所消化破坏，用药量也可以控制得非常精准。但这种方法主要适用于急重症病人或一些无法替代的情况。
1、首先，频繁的灌肠可能损伤孩子的肠道黏膜，导致肠道炎症或感染的风险增加。其次，灌肠过程中如果操作不当，可能会引起肠道穿孔或肠道出血，这是一种严重的并发症，需要及时就医处理。此外，灌肠还可能扰乱孩子的正常生理功能，如肠道菌群失衡，影响消化吸收能力。
2、物理降温。发烧对于宝宝的免疫机能是有好处的，通过宝宝身体免疫机能的战斗，击退了发烧，下一次会不容易发烧。但是妈妈也能给予一些外界的刺激，帮助退烧，例如用冷水浸泡的毛巾，轻轻的擦拭宝宝的身体，帮助宝宝降低大量的表皮的温度，帮助退烧。多喝水。
3、婴幼儿的肠道非常薄弱，长期且操作不规范的灌肠手法，容易造成肠道穿孔，简单来说就是把肠子捅破了。而且损伤的肠道还会被粪便和细菌“袭击”引发感染。所以，1岁以内的宝宝不要轻易灌肠。
4、骨髓损害 2004年3月9日，某村村医给一名3岁咳嗽患儿灌肠后出现洗肉汤样大便，经上级医院抢救无效后死亡，原因就是村医超剂量用药、不规范用药。
5、感冒发热时，宝宝的消热栓可能效果不佳，这时可以考虑到卫生室进行灌肠治疗。灌肠疗法在处理肠道问题上，尤其是对于缓解因感染引起的发热，具有一定的效果。这种治疗方法能够直接作用于肠道，帮助清除体内的毒素和病菌，从而达到降温的目的。
1、坏处： 可能带来伤害：由于灌肠是将药物直接送入直肠，有可能对婴儿的直肠黏膜造成刺激或损伤，甚至可能引发感染。 药物使用不当风险：灌肠使用的药物剂量和浓度若控制不当，可能对婴儿造成不良影响，且灌肠方式的药物吸收速度和程度不易控制，增加了用药风险。
2、局部的刺激，有的孩子灌肠以后容易出现腹泻或者感染。局部如果造成的灌肠损伤也是可能出现的。灌肠液里边都是什么药，是不好控制的。有些医生会加一些地塞米松，还有其它的一些药物，可能临床退烧效果非常显著，为了追求最大的临床症状的改善，其实它的副作用也是存在的，不建议用地塞米松退烧。
3、药物灌肠退烧能够损害肠道黏膜，宝宝肠道娇嫩，药物灌肠退热容易出现药物过敏反应等，有的时候药物还容易引起肠道黏膜的损害、溃疡、出血，严重的情况会出现肠道穿孔。
4、从而达到退烧作用。其好处在于对药物吸收快，而且不经过胃，有利于减轻对胃粘膜的损伤，减轻胃的副作用。另外，直肠血管吸收快，有利于迅速达到退烧的作用，而且避免孩子不肯服用药物的缺点。坏处在于灌肠治疗会刺激肠的蠕动，会导致腹泻，若操作不当，还可能造成肠粘膜的损伤。
5、另一个重要问题是，某些抗生素的使用会破坏肠道内的有益菌群，导致菌群失调。这种失调可能引发继发性感染，对孩子的健康造成进一步威胁。此外，灌肠过程中可能会损伤直肠黏膜，引发局部炎症反应，增加不适感。鉴于上述因素，医生通常会尽量避免使用灌肠治疗发烧。
6、小孩发烧灌肠的副作用主要包括以下几个方面： 直肠黏膜或肛门损伤 如果灌肠操作粗暴，容易造成直肠黏膜或肛门的损伤，使孩子感到不适。 黏膜损伤还可能导致感染情况的发生。 脱水与低体温 灌肠给药通过直肠迅速退热，孩子往往出汗严重。 如不及时补充水分，可能出现脱水、低体温的情况。
发烧灌肠的好处主要包括快速退烧，尤其在特定情况下；坏处则主要体现在对特定人群可能不适用。好处： 快速退烧：当孩子发烧后，尤其是体温超过35度且无法通过口服药物退烧时，或者孩子呕吐严重拒绝吃药时，灌肠可以作为一种有效的替代方法，帮助快速退烧。
儿童发烧灌肠好处不多，坏处不少。主要的好处可能是对一些吃药比较困难、呕吐、不接受喂药的孩子觉着比较方便，但是也不建议用这种方法。因为现在还有小儿退热栓，也是直肠给药，让直肠吸收，而且这个栓剂制作的非常的柔软，容易使用，而且质量保证安全。
当小孩子发烧时，使用灌肠方式进行治疗可能带来一些潜在的负面影响。其中，直肠黏膜皱褶减少，导致吸收面积减小，使得药物进入体内的速度和量都受限，影响治疗效果。此外，灌肠并非一种安全、无菌的治疗手段。肠道内部栖息着大量细菌，这些细菌有可能随着灌肠液进入肠道内部，增加感染风险。
但是灌肠的时候，如果操作比较粗鲁，容易造成孩子直肠黏膜或者是肛门损伤，会让孩子感觉比较不舒服，还有可能会导致感染的情况发生。但是，如果操作的时候比较轻柔，往往不会损伤肠黏膜，一般情况下也没有什么副作用。
